Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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FOXC1Q12948 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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FOXC1Q12948 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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FOXC1Q12948 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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FOXC1Q12948 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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FOXC1Q12948 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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