Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms