Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STX4Q12846 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
STX4Q12846 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STX4Q12846 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
STX4Q12846 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
STX4Q12846 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
STX4Q12846 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
STX4Q12846 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
STX4Q12846 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
STX4Q12846 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STX4Q12846 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STX4Q12846 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
STX4Q12846 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STX4Q12846 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
STX4Q12846 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
STX4Q12846 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STX4Q12846 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STX4Q12846 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STX4Q12846 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
STX4Q12846 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STX4Q12846 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STX4Q12846 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STX4Q12846 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
STX4Q12846 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
STX4Q12846 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
STX4Q12846 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STX4Q12846 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STX4Q12846 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
STX4Q12846 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
STX4Q12846 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
STX4Q12846 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STX4Q12846 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
STX4Q12846 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
STX4Q12846 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
STX4Q12846 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
STX4Q12846 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
STX4Q12846 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
STX4Q12846 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
STX4Q12846 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
STX4Q12846 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
STX4Q12846 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
STX4Q12846 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
STX4Q12846 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
STX4Q12846 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STX4Q12846 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STX4Q12846 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STX4Q12846 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STX4Q12846 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STX4Q12846 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STX4Q12846 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STX4Q12846 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STX4Q12846 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
STX4Q12846 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STX4Q12846 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STX4Q12846 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STX4Q12846 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STX4Q12846 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STX4Q12846 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STX4Q12846 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STX4Q12846 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STX4Q12846 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
STX4Q12846 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STX4Q12846 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STX4Q12846 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STX4Q12846 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STX4Q12846 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX4Q12846 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX4Q12846 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX4Q12846 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX4Q12846 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX4Q12846 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX4Q12846 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX4Q12846 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX4Q12846 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
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