Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 COX5AYNL052W 462 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YNL109WYNL109W 546 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 ATG5YPL149W 885 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 CNA1YLR433C 1662 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 EMP46YLR080W 1335 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YDR491CYDR491C 492 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YER107W-AYER107W-A 321 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 AGX1YFL030W 1158 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 HIT1YJR055W 495 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YLL056CYLL056C 897 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 RAD33YML011C 534 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YMR254CYMR254C 309 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YMR320WYMR320W 306 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 LST8YNL006W 912 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 MDG1YNL173C 1101 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 AIM39YOL053W 1188 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 OST2YOR103C 393 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 MCM16YPR046W 546 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YCL012CYCL012C 405 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 IME2YJL106W 1938 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 ISC1YER019W 1434 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 DOT1YDR440W 1749 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 PAP2YOL115W 1755 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YHR020WYHR020W 2067 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 BUD8YLR353W 1812 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YCL076WYCL076W 744 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 RIM1YCR028C-A 408 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 RPN11YFR004W 921 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 LAG1YHL003C 1236 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 DFG10YIL049W 762 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 QCR8YJL166W 285 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 RRT16YNL105W 429 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 RPL3YOR063W 1164 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 CAT5YOR125C 702 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 TMA16YOR252W 537 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YPR076WYPR076W 375 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 RTT109YLL002W 1311 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 KNS1YLL019C 2214 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 AIM3YBR108W 2844 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 GAS4YOL132W 1416 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 STT3YGL022W 2157 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 GIT1YCR098C 1557 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 HED1YDR014W-A 489 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YHR130CYHR130C 336 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 SYN8YAL014C 768 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YKL077WYKL077W 1179 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YLR224WYLR224W 1110 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YLR317WYLR317W 435 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 ARC18YLR370C 537 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YMR141CYMR141C 309 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 MRPL10YNL284C 969 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 PHR1YOR386W 1698 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 TBF1YPL128C 1689 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 YRB30YGL164C 1323 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 MPH3YJR160C 1809 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 ALG6YOR002W 1635 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 MAL12YGR292W 1755 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 JJJ1YNL227C 1773 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 MAL32YBR299W 1755 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 UBC13YDR092W 462 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 GPI19YDR437W 423 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 BIM1YER016W 1035 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 YPT1YFL038C 621 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 YIL029CYIL029C 429 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 DAL3YIR032C 588 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 ICS3YJL077C 396 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 TFS1YLR178C 660 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 YNL200CYNL200C 741 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 MRP21YBL090W 534 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 YOR053WYOR053W 342 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 SPE3YPR069C 882 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 BIO3YNR058W 1443 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 VMA2YBR127C 1554 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 SWF1YDR126W 1011 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 YER119C-AYER119C-A 372 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 PRM8YGL053W 714 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 FRA2YGL220W 363 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 PEX21YGR239C 867 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 LCB3YJL134W 1230 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 LDB7YBL006C 543 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 YMR130WYMR130W 909 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 MRPL19YNL185C 477 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 MCK1YNL307C 1128 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 YBR113WYBR113W 483 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 AVT4YNL101W 2142 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 RMD6YEL072W 696 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 MAG1YER142C 891 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 HEM2YGL040C 1029 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 SNL1YIL016W 480 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 YLR297WYLR297W 390 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 TSA1YML028W 591 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 IMP2YMR035W 534 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 TMA46YOR091W 1038 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 CUR1YPR158W 759 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 YBR285WYBR285W 435 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 IMA3YIL172C 1770 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BLQ12266 IMA4YJL221C 1770 nt5.87□□□□□ -1.47
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