Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 MRPL20YKR085C 588 nt4.2□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 GCD7YLR291C 1146 nt4.2□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 IBD2YNL164C 1056 nt4.2□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 MED7YOL135C 669 nt4.2□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt4.2□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 MCP2YLR253W 1710 nt4.2□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 APP1YNL094W 1764 nt4.19□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 VHS3YOR054C 2025 nt4.19□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 SLX8YER116C 825 nt4.19□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 UTP11YKL099C 753 nt4.19□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 EFM2YBR271W 1260 nt4.19□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 MTR10YOR160W 2919 nt4.18□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 TEL1YBL088C 8364 nt4.18□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 snR63snR63 255 nt4.18□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 NUS1YDL193W 1128 nt4.18□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 SPI1YER150W 447 nt4.18□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 YGL132WYGL132W 336 nt4.18□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 LSB1YGR136W 726 nt4.18□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 HRT3YLR097C 1035 nt4.18□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 YNL234WYNL234W 1281 nt4.18□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 SNF8YPL002C 702 nt4.18□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt4.18□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 GZF3YJL110C 1656 nt4.18□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 NTA1YJR062C 1374 nt4.17□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 YDL094CYDL094C 510 nt4.17□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 RPS11AYDR025W 471 nt4.17□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 YGL188CYGL188C 174 nt4.17□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 YMR130WYMR130W 909 nt4.17□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 RPL19AYBR084C-A 570 nt4.17□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 RNA14YMR061W 2034 nt4.17□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 UBP10YNL186W 2379 nt4.17□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 YDL026WYDL026W 312 nt4.16□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 COS12YGL263W 1143 nt4.16□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 RPL8AYHL033C 771 nt4.16□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt4.16□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 FUR1YHR128W 651 nt4.16□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt4.16□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 HIS6YIL020C 786 nt4.16□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 RAD10YML095C 633 nt4.16□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 TMA16YOR252W 537 nt4.16□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 NHX1YDR456W 1902 nt4.16□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 YRB30YGL164C 1323 nt4.16□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 SMF1YOL122C 1728 nt4.15□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 TRF5YNL299W 1929 nt4.15□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 POL1YNL102W 4407 nt4.15□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 RAD54YGL163C 2697 nt4.15□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 YSH1YLR277C 2340 nt4.15□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 AHA1YDR214W 1053 nt4.15□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.15□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 IGO2YHR132W-A 396 nt4.15□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 ATP12YJL180C 978 nt4.15□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 DCS1YLR270W 1053 nt4.15□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 BLS1YLR408C 369 nt4.15□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 ASC1YMR116C 960 nt4.15□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 DSC2YOL073C 969 nt4.15□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 SLM5YCR024C 1479 nt4.15□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 GLO3YER122C 1482 nt4.15□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 YLR152CYLR152C 1731 nt4.15□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 FAR8YMR029C 1572 nt4.14□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 PTA1YAL043C 2358 nt4.14□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 RIA1YNL163C 3333 nt4.14□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 YCL068CYCL068C 783 nt4.14□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 YDR161WYDR161W 1164 nt4.14□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 DIN7YDR263C 1293 nt4.14□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 PRE9YGR135W 777 nt4.14□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 CDC12YHR107C 1224 nt4.14□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 PIR3YKL163W 978 nt4.14□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 OMA1YKR087C 1038 nt4.14□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 MAP1YLR244C 1164 nt4.14□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 PRX1YBL064C 786 nt4.14□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 RET3YPL010W 570 nt4.14□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 KIN4YOR233W 2403 nt4.14□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 CWH43YCR017C 2862 nt4.14□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 ECM22YLR228C 2445 nt4.13□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 VPS73YGL104C 1461 nt4.13□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 HPR1YDR138W 2259 nt4.13□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 NBP2YDR162C 711 nt4.13□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 YGL088WYGL088W 366 nt4.13□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 MRPL6YHR147C 645 nt4.13□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 CDC73YLR418C 1182 nt4.13□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 PFA4YOL003C 1137 nt4.13□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 YAR1YPL239W 603 nt4.13□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 HOS3YPL116W 2094 nt4.13□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 SMP3YOR149C 1551 nt4.13□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 NOC2YOR206W 2133 nt4.13□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 SIP1YDR422C 2448 nt4.13□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 TPA1YER049W 1935 nt4.13□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 POL31YJR006W 1464 nt4.12□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 LOS1YKL205W 3303 nt4.12□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 YCL075WYCL075W 441 nt4.12□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 BET1YIL004C 429 nt4.12□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 YJL028WYJL028W 336 nt4.12□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 YBL059WYBL059W 582 nt4.12□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 RPL18BYNL301C 561 nt4.12□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 RSC3YDR303C 2658 nt4.12□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 GAT2YMR136W 1683 nt4.12□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 MIS1YBR084W 2928 nt4.11□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 ARO80YDR421W 2853 nt4.11□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 CDC14YFR028C 1656 nt4.11□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 MRPS35YGR165W 1038 nt4.11□□□□□ -1.75
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