Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CGNL1Q0VF96 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms