Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ACSM2AQ08AH3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms