Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSC1Q08554 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms