Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4DQ08499 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms