Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 MDG1YNL173C 1101 nt4.85□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 TRM10YOL093W 882 nt4.85□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 snR44snR44 211 nt4.85□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 MMT1YMR177W 1533 nt4.85□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 MNT2YGL257C 1677 nt4.85□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 RTK1YDL025C 1863 nt4.85□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 CRT10YOL063C 2874 nt4.85□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 BUD7YOR299W 2241 nt4.84□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 AZR1YGR224W 1842 nt4.84□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 EAR1YMR171C 1653 nt4.84□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 YFL040WYFL040W 1623 nt4.84□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 HXT14YNL318C 1623 nt4.84□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 STP4YDL048C 1473 nt4.84□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 POL31YJR006W 1464 nt4.84□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 VAC17YCL063W 1272 nt4.84□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 SRB7YDR308C 423 nt4.84□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 MEI4YER044C-A 1227 nt4.84□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 RPL22BYFL034C-A 369 nt4.84□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 COS8YHL048W 1146 nt4.84□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 MMM1YLL006W 1281 nt4.84□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 ELO3YLR372W 1038 nt4.84□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 YNL181WYNL181W 1224 nt4.84□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt4.84□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 SME1YOR159C 285 nt4.84□□□□□ -1.63
SGO1Q08490 VHC1YBR235W 3363 nt4.84□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 FUI1YBL042C 1920 nt4.84□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 SMF1YOL122C 1728 nt4.83□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 RPN4YDL020C 1596 nt4.83□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt4.83□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt4.83□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt4.83□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 FRA2YGL220W 363 nt4.83□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 PRP38YGR075C 729 nt4.83□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 AIM19YIL087C 474 nt4.83□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 MRPL20YKR085C 588 nt4.83□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 RPL15BYMR121C 615 nt4.83□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 GPI12YMR281W 915 nt4.83□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 ECM23YPL021W 564 nt4.83□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 QCR2YPR191W 1107 nt4.83□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 YBR287WYBR287W 1284 nt4.83□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.83□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 ATH1YPR026W 3636 nt4.83□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 BRE2YLR015W 1518 nt4.82□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 NGL3YML118W 1518 nt4.82□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 BLM10YFL007W 6432 nt4.82□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 MSA1YOR066W 1890 nt4.82□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 YCL076WYCL076W 744 nt4.82□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 YDL012CYDL012C 324 nt4.82□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 TRM8YDL201W 861 nt4.82□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 DOG2YHR043C 741 nt4.82□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 DOG1YHR044C 741 nt4.82□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 PFS1YHR185C 714 nt4.82□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 YJL218WYJL218W 591 nt4.82□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 FIP1YJR093C 984 nt4.82□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 GCD7YLR291C 1146 nt4.82□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 ATG5YPL149W 885 nt4.82□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 MDL1YLR188W 2088 nt4.82□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 DNF2YDR093W 4839 nt4.82□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 MMT2YPL224C 1455 nt4.81□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 CTF13YMR094W 1437 nt4.81□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 PCA1YBR295W 3651 nt4.81□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 HTB1YDR224C 396 nt4.81□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 THI5YFL058W 1023 nt4.81□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 MRPL49YJL096W 486 nt4.81□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 YKL162CYKL162C 1209 nt4.81□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 MRPL16YBL038W 699 nt4.81□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 COG5YNL051W 1212 nt4.81□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 THI12YNL332W 1023 nt4.81□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 RPC34YNR003C 954 nt4.81□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 RAS1YOR101W 930 nt4.81□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 KTR7YIL085C 1554 nt4.81□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 FRT2YAL028W 1587 nt4.81□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 MAG2YLR427W 2013 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 SPT14YPL175W 1359 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 MCM4YPR019W 2802 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 ALG11YNL048W 1647 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 ZUO1YGR285C 1302 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 SUP45YBR143C 1314 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 YCR101CYCR101C 549 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 NRG1YDR043C 696 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 RPL34AYER056C-A 366 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 YGL193CYGL193C 312 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 YGR016WYGR016W 573 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 PCL7YIL050W 858 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 YKL202WYKL202W 582 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 YPT6YLR262C 648 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 TEM1YML064C 738 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 RUF22RUF22 515 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 MUD1YBR119W 897 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 snR37snR37 386 nt4.8□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 YNR066CYNR066C 1311 nt4.79□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 SAG1YJR004C 1953 nt4.79□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 COBQ0105 1158 nt4.79□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 SPT15YER148W 723 nt4.79□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 YGL117WYGL117W 798 nt4.79□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 COX6YHR051W 447 nt4.79□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 YBL059WYBL059W 582 nt4.79□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 PRX1YBL064C 786 nt4.79□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt4.79□□□□□ -1.64
SGO1Q08490 YOR283WYOR283W 693 nt4.79□□□□□ -1.64
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