Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms