Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX4Q06945 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms