Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEUP1Q05D60 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms