Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCZQ05513 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms