Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms