Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms