Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms