Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CAV1Q03135 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV1Q03135 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms