Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB1Q02818 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms