Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms