Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ID3Q02535 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ID3Q02535 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ID3Q02535 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ID3Q02535 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ID3Q02535 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ID3Q02535 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ID3Q02535 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ID3Q02535 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ID3Q02535 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ID3Q02535 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ID3Q02535 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ID3Q02535 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ID3Q02535 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ID3Q02535 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ID3Q02535 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ID3Q02535 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ID3Q02535 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ID3Q02535 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ID3Q02535 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ID3Q02535 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ID3Q02535 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ID3Q02535 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ID3Q02535 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ID3Q02535 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ID3Q02535 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ID3Q02535 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ID3Q02535 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ID3Q02535 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ID3Q02535 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ID3Q02535 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ID3Q02535 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ID3Q02535 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ID3Q02535 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ID3Q02535 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ID3Q02535 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ID3Q02535 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ID3Q02535 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ID3Q02535 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ID3Q02535 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ID3Q02535 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ID3Q02535 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ID3Q02535 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ID3Q02535 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ID3Q02535 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ID3Q02535 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ID3Q02535 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ID3Q02535 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ID3Q02535 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ID3Q02535 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ID3Q02535 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ID3Q02535 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ID3Q02535 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ID3Q02535 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ID3Q02535 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ID3Q02535 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ID3Q02535 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ID3Q02535 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms