Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP4Q02446 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP4Q02446 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SP4Q02446 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP4Q02446 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP4Q02446 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP4Q02446 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP4Q02446 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP4Q02446 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SP4Q02446 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP4Q02446 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP4Q02446 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP4Q02446 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP4Q02446 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP4Q02446 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP4Q02446 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP4Q02446 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP4Q02446 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP4Q02446 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP4Q02446 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP4Q02446 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP4Q02446 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP4Q02446 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP4Q02446 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP4Q02446 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP4Q02446 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP4Q02446 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP4Q02446 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SP4Q02446 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SP4Q02446 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP4Q02446 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP4Q02446 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP4Q02446 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP4Q02446 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP4Q02446 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP4Q02446 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP4Q02446 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP4Q02446 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SP4Q02446 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SP4Q02446 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SP4Q02446 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SP4Q02446 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SP4Q02446 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SP4Q02446 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SP4Q02446 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SP4Q02446 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP4Q02446 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP4Q02446 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP4Q02446 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP4Q02446 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP4Q02446 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP4Q02446 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP4Q02446 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP4Q02446 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP4Q02446 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP4Q02446 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP4Q02446 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP4Q02446 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP4Q02446 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP4Q02446 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP4Q02446 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP4Q02446 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP4Q02446 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP4Q02446 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP4Q02446 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SP4Q02446 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP4Q02446 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP4Q02446 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP4Q02446 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SP4Q02446 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SP4Q02446 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SP4Q02446 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SP4Q02446 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SP4Q02446 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SP4Q02446 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SP4Q02446 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SP4Q02446 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SP4Q02446 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SP4Q02446 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SP4Q02446 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SP4Q02446 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SP4Q02446 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SP4Q02446 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SP4Q02446 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP4Q02446 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP4Q02446 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP4Q02446 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP4Q02446 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP4Q02446 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP4Q02446 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SP4Q02446 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP4Q02446 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP4Q02446 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP4Q02446 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP4Q02446 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP4Q02446 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SP4Q02446 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SP4Q02446 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SP4Q02446 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SP4Q02446 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms