Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN2Q02246 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms