Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 IGO2YHR132W-A 396 nt3.36□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 IST1YNL265C 897 nt3.36□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 SCD6YPR129W 1050 nt3.36□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 DER1YBR201W 636 nt3.36□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 MTR4YJL050W 3222 nt3.36□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 URA2YJL130C 6645 nt3.35□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 YKL050CYKL050C 2769 nt3.35□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 SSM4YIL030C 3960 nt3.35□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 YDR271CYDR271C 372 nt3.35□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 COX18YGR062C 951 nt3.35□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 YHL026CYHL026C 948 nt3.35□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 SOD1YJR104C 465 nt3.35□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 PHA2YNL316C 1005 nt3.35□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 YPL088WYPL088W 1029 nt3.35□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 snR17asnR17a 333 nt3.35□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 POF1YCL047C 777 nt3.35□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 YRB30YGL164C 1323 nt3.35□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 FCF1YDR339C 570 nt3.34□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 RPS18AYDR450W 441 nt3.34□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 YGR291CYGR291C 222 nt3.34□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 YIL152WYIL152W 708 nt3.34□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.34□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt3.34□□□□□ -1.87
NUP49Q02199 RDS1YCR106W 2499 nt3.34□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 YPR022CYPR022C 3402 nt3.33□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 MSD1YPL104W 1977 nt3.33□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 ENT5YDR153C 1236 nt3.33□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 BAT2YJR148W 1131 nt3.33□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 REH1YLR387C 1299 nt3.33□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 ATG8YBL078C 354 nt3.33□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 YPL073CYPL073C 486 nt3.33□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 REB1YBR049C 2433 nt3.33□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 RRN6YBL014C 2685 nt3.33□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 SMC3YJL074C 3693 nt3.32□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 FAP7YDL166C 594 nt3.32□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.32□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 RPS8BYER102W 603 nt3.32□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 YHR173CYHR173C 339 nt3.32□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 YJR037WYJR037W 384 nt3.32□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 RAD33YML011C 534 nt3.32□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 RPS8AYBL072C 603 nt3.32□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 CTR1YPR124W 1221 nt3.32□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 NGL3YML118W 1518 nt3.32□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 MIH1YMR036C 1665 nt3.32□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 FUN12YAL035W 3009 nt3.32□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 PMT6YGR199W 2280 nt3.31□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 ORC4YPR162C 1590 nt3.31□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 RNT1YMR239C 1416 nt3.31□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 YEL074WYEL074W 339 nt3.31□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 CDC73YLR418C 1182 nt3.31□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 MOH1YBL049W 417 nt3.31□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 ECM8YBR076W 1065 nt3.31□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 RKM3YBR030W 1659 nt3.3□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 ALG11YNL048W 1647 nt3.3□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 SUC2YIL162W 1599 nt3.3□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 POL1YNL102W 4407 nt3.3□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 TSR1YDL060W 2367 nt3.3□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 VID27YNL212W 2349 nt3.3□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 MSW1YDR268W 1140 nt3.3□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 RAI1YGL246C 1164 nt3.3□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 ENT3YJR125C 1227 nt3.3□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 YLR049CYLR049C 1287 nt3.3□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 PRM9YAR031W 897 nt3.3□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 FLD1YLR404W 858 nt3.3□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 RET3YPL010W 570 nt3.3□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 CKS1YBR135W 453 nt3.3□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 PDR12YPL058C 4536 nt3.3□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 NAT1YDL040C 2565 nt3.3□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 IMD4YML056C 1575 nt3.29□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 HEF3YNL014W 3135 nt3.29□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 YLR177WYLR177W 1887 nt3.29□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 MDN1YLR106C 14733 nt3.29□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 MNR2YKL064W 2910 nt3.29□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 PKH1YDR490C 2301 nt3.29□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 MAF1YDR005C 1188 nt3.29□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 YFL065CYFL065C 309 nt3.29□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 PXR1YGR280C 816 nt3.29□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 CDC12YHR107C 1224 nt3.29□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 PRX1YBL064C 786 nt3.29□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 ASI2YNL159C 870 nt3.29□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 GLO4YOR040W 858 nt3.29□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 YBR137WYBR137W 540 nt3.29□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 TCB3YML072C 4638 nt3.29□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 RTS1YOR014W 2274 nt3.28□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 GPI1YGR216C 1830 nt3.28□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 LTV1YKL143W 1392 nt3.28□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 DXO1YDR370C 1329 nt3.28□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 ZDS2YML109W 2829 nt3.28□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 GZF3YJL110C 1656 nt3.28□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 YHI9YHR029C 885 nt3.28□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 YLR124WYLR124W 345 nt3.28□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 URA4YLR420W 1095 nt3.28□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 YPL014WYPL014W 1146 nt3.28□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 NRG2YBR066C 663 nt3.28□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 GPB1YOR371C 2694 nt3.28□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 YJR030CYJR030C 2238 nt3.28□□□□□ -1.88
NUP49Q02199 SEC6YIL068C 2418 nt3.28□□□□□ -1.89
NUP49Q02199 RRP5YMR229C 5190 nt3.27□□□□□ -1.89
NUP49Q02199 YHB1YGR234W 1200 nt3.27□□□□□ -1.89
NUP49Q02199 DSC2YOL073C 969 nt3.27□□□□□ -1.89
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