Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms