Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP1P78357 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTNAP1P78357 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms