Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO1P63165 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms