Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF6P62330 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF6P62330 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF6P62330 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF6P62330 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF6P62330 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF6P62330 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF6P62330 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF6P62330 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF6P62330 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF6P62330 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF6P62330 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF6P62330 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF6P62330 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF6P62330 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF6P62330 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF6P62330 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF6P62330 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF6P62330 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF6P62330 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF6P62330 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF6P62330 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF6P62330 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF6P62330 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF6P62330 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF6P62330 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF6P62330 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF6P62330 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF6P62330 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF6P62330 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF6P62330 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF6P62330 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF6P62330 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF6P62330 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF6P62330 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF6P62330 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF6P62330 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF6P62330 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF6P62330 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF6P62330 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF6P62330 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF6P62330 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF6P62330 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF6P62330 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF6P62330 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF6P62330 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF6P62330 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF6P62330 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF6P62330 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF6P62330 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF6P62330 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF6P62330 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF6P62330 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF6P62330 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF6P62330 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF6P62330 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF6P62330 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF6P62330 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF6P62330 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF6P62330 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF6P62330 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF6P62330 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF6P62330 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF6P62330 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF6P62330 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF6P62330 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF6P62330 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF6P62330 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF6P62330 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF6P62330 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF6P62330 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF6P62330 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF6P62330 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF6P62330 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF6P62330 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF6P62330 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF6P62330 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF6P62330 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF6P62330 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF6P62330 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF6P62330 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF6P62330 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF6P62330 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF6P62330 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF6P62330 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF6P62330 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF6P62330 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF6P62330 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF6P62330 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF6P62330 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF6P62330 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF6P62330 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF6P62330 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF6P62330 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms