Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms