Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVK-21P61565 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-21P61565 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms