Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS3AP61247 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms