Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVFC1P60507 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms