Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF3P57682 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF3P57682 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF3P57682 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF3P57682 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF3P57682 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF3P57682 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF3P57682 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF3P57682 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF3P57682 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF3P57682 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF3P57682 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF3P57682 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF3P57682 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF3P57682 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF3P57682 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF3P57682 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF3P57682 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF3P57682 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF3P57682 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLF3P57682 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF3P57682 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF3P57682 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF3P57682 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF3P57682 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF3P57682 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF3P57682 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF3P57682 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF3P57682 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF3P57682 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF3P57682 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF3P57682 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF3P57682 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF3P57682 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF3P57682 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF3P57682 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF3P57682 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF3P57682 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF3P57682 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF3P57682 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF3P57682 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF3P57682 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF3P57682 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF3P57682 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF3P57682 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF3P57682 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF3P57682 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF3P57682 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF3P57682 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF3P57682 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF3P57682 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF3P57682 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF3P57682 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF3P57682 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF3P57682 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF3P57682 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF3P57682 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF3P57682 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF3P57682 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF3P57682 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF3P57682 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF3P57682 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF3P57682 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF3P57682 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF3P57682 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF3P57682 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF3P57682 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF3P57682 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF3P57682 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF3P57682 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF3P57682 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF3P57682 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF3P57682 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF3P57682 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF3P57682 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF3P57682 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF3P57682 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF3P57682 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF3P57682 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF3P57682 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF3P57682 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF3P57682 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF3P57682 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms