Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RIPK4P57078 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms