Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX17P56962 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX17P56962 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX17P56962 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX17P56962 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX17P56962 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX17P56962 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX17P56962 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX17P56962 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX17P56962 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX17P56962 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX17P56962 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX17P56962 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX17P56962 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX17P56962 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX17P56962 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX17P56962 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX17P56962 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX17P56962 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX17P56962 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX17P56962 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX17P56962 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX17P56962 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX17P56962 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX17P56962 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX17P56962 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX17P56962 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX17P56962 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX17P56962 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX17P56962 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX17P56962 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX17P56962 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX17P56962 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX17P56962 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX17P56962 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX17P56962 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX17P56962 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX17P56962 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX17P56962 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX17P56962 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX17P56962 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX17P56962 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX17P56962 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX17P56962 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX17P56962 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX17P56962 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX17P56962 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX17P56962 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX17P56962 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX17P56962 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX17P56962 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX17P56962 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX17P56962 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX17P56962 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX17P56962 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STX17P56962 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX17P56962 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STX17P56962 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STX17P56962 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STX17P56962 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STX17P56962 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX17P56962 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX17P56962 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX17P56962 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX17P56962 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX17P56962 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX17P56962 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX17P56962 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX17P56962 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX17P56962 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX17P56962 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX17P56962 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX17P56962 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX17P56962 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX17P56962 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX17P56962 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX17P56962 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX17P56962 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX17P56962 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX17P56962 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX17P56962 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX17P56962 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX17P56962 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STX17P56962 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX17P56962 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX17P56962 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX17P56962 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX17P56962 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX17P56962 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX17P56962 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX17P56962 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX17P56962 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX17P56962 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX17P56962 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX17P56962 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX17P56962 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX17P56962 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX17P56962 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX17P56962 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX17P56962 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms