Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC4P56524 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms