Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL23P55773 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL23P55773 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL23P55773 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL23P55773 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL23P55773 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL23P55773 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL23P55773 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL23P55773 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL23P55773 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL23P55773 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL23P55773 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL23P55773 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCL23P55773 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL23P55773 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL23P55773 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL23P55773 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL23P55773 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL23P55773 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL23P55773 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL23P55773 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL23P55773 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL23P55773 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL23P55773 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL23P55773 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL23P55773 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL23P55773 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL23P55773 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL23P55773 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL23P55773 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL23P55773 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL23P55773 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL23P55773 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL23P55773 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL23P55773 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL23P55773 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL23P55773 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL23P55773 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL23P55773 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL23P55773 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL23P55773 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL23P55773 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL23P55773 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL23P55773 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL23P55773 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL23P55773 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL23P55773 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL23P55773 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL23P55773 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL23P55773 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL23P55773 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL23P55773 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL23P55773 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL23P55773 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL23P55773 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL23P55773 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL23P55773 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL23P55773 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL23P55773 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL23P55773 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL23P55773 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL23P55773 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL23P55773 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL23P55773 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL23P55773 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL23P55773 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL23P55773 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL23P55773 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL23P55773 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL23P55773 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL23P55773 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL23P55773 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL23P55773 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL23P55773 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL23P55773 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL23P55773 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL23P55773 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL23P55773 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL23P55773 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL23P55773 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL23P55773 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL23P55773 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL23P55773 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL23P55773 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL23P55773 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL23P55773 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL23P55773 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL23P55773 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCL23P55773 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL23P55773 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCL23P55773 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCL23P55773 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCL23P55773 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL23P55773 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL23P55773 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL23P55773 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL23P55773 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL23P55773 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL23P55773 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL23P55773 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms