Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN3P54252 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms