Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST1P52848 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST1P52848 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST1P52848 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST1P52848 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST1P52848 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST1P52848 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST1P52848 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST1P52848 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST1P52848 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST1P52848 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST1P52848 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST1P52848 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST1P52848 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST1P52848 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST1P52848 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST1P52848 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST1P52848 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST1P52848 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST1P52848 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST1P52848 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST1P52848 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST1P52848 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST1P52848 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST1P52848 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST1P52848 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST1P52848 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST1P52848 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDST1P52848 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NDST1P52848 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NDST1P52848 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST1P52848 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST1P52848 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST1P52848 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST1P52848 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST1P52848 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST1P52848 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST1P52848 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST1P52848 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST1P52848 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST1P52848 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST1P52848 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST1P52848 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST1P52848 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST1P52848 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST1P52848 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST1P52848 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST1P52848 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST1P52848 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST1P52848 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST1P52848 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST1P52848 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST1P52848 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST1P52848 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST1P52848 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST1P52848 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST1P52848 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST1P52848 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST1P52848 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST1P52848 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST1P52848 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST1P52848 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST1P52848 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST1P52848 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST1P52848 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST1P52848 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST1P52848 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST1P52848 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST1P52848 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST1P52848 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST1P52848 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST1P52848 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST1P52848 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST1P52848 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST1P52848 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST1P52848 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST1P52848 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST1P52848 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST1P52848 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST1P52848 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST1P52848 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST1P52848 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST1P52848 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST1P52848 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST1P52848 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST1P52848 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST1P52848 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST1P52848 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST1P52848 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST1P52848 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST1P52848 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST1P52848 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST1P52848 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST1P52848 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST1P52848 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST1P52848 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST1P52848 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST1P52848 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST1P52848 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST1P52848 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms