Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCAMP50895 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCAMP50895 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCAMP50895 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCAMP50895 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCAMP50895 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCAMP50895 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCAMP50895 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BCAMP50895 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCAMP50895 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCAMP50895 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCAMP50895 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCAMP50895 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCAMP50895 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCAMP50895 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCAMP50895 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCAMP50895 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCAMP50895 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BCAMP50895 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCAMP50895 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BCAMP50895 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCAMP50895 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAMP50895 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAMP50895 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAMP50895 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAMP50895 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAMP50895 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAMP50895 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAMP50895 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAMP50895 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAMP50895 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAMP50895 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCAMP50895 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCAMP50895 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCAMP50895 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCAMP50895 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCAMP50895 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCAMP50895 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BCAMP50895 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BCAMP50895 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BCAMP50895 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCAMP50895 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCAMP50895 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCAMP50895 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCAMP50895 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCAMP50895 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCAMP50895 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BCAMP50895 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCAMP50895 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCAMP50895 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCAMP50895 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BCAMP50895 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCAMP50895 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCAMP50895 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCAMP50895 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCAMP50895 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCAMP50895 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCAMP50895 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BCAMP50895 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCAMP50895 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCAMP50895 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCAMP50895 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCAMP50895 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BCAMP50895 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCAMP50895 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCAMP50895 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCAMP50895 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCAMP50895 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCAMP50895 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCAMP50895 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCAMP50895 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCAMP50895 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCAMP50895 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCAMP50895 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCAMP50895 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCAMP50895 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCAMP50895 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCAMP50895 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCAMP50895 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAMP50895 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAMP50895 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAMP50895 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAMP50895 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAMP50895 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAMP50895 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAMP50895 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAMP50895 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAMP50895 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAMP50895 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAMP50895 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms