Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBP50607 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBP50607 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBP50607 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBP50607 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBP50607 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBP50607 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBP50607 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBP50607 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBP50607 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBP50607 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBP50607 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBP50607 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBP50607 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBP50607 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBP50607 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBP50607 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBP50607 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBP50607 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBP50607 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBP50607 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBP50607 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBP50607 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBP50607 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBP50607 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBP50607 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBP50607 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBP50607 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBP50607 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBP50607 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBP50607 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBP50607 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBP50607 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBP50607 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBP50607 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBP50607 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBP50607 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBP50607 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBP50607 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBP50607 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBP50607 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBP50607 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBP50607 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBP50607 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBP50607 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBP50607 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBP50607 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBP50607 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBP50607 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBP50607 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBP50607 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBP50607 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBP50607 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBP50607 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBP50607 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBP50607 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBP50607 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBP50607 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBP50607 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBP50607 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBP50607 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBP50607 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBP50607 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBP50607 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBP50607 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBP50607 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBP50607 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBP50607 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBP50607 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBP50607 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms