Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG4P49917 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG4P49917 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG4P49917 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG4P49917 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG4P49917 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG4P49917 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG4P49917 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG4P49917 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG4P49917 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG4P49917 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG4P49917 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG4P49917 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG4P49917 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG4P49917 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG4P49917 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG4P49917 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG4P49917 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG4P49917 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG4P49917 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG4P49917 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG4P49917 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG4P49917 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG4P49917 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG4P49917 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG4P49917 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG4P49917 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG4P49917 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG4P49917 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG4P49917 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG4P49917 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG4P49917 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG4P49917 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG4P49917 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG4P49917 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG4P49917 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG4P49917 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG4P49917 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG4P49917 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG4P49917 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG4P49917 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LIG4P49917 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG4P49917 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG4P49917 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG4P49917 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG4P49917 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG4P49917 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG4P49917 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIG4P49917 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIG4P49917 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIG4P49917 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIG4P49917 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIG4P49917 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIG4P49917 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIG4P49917 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIG4P49917 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LIG4P49917 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIG4P49917 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIG4P49917 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIG4P49917 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIG4P49917 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIG4P49917 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIG4P49917 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIG4P49917 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIG4P49917 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIG4P49917 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIG4P49917 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIG4P49917 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIG4P49917 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LIG4P49917 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIG4P49917 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIG4P49917 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIG4P49917 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIG4P49917 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIG4P49917 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIG4P49917 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIG4P49917 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIG4P49917 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIG4P49917 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIG4P49917 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIG4P49917 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIG4P49917 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIG4P49917 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LIG4P49917 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIG4P49917 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIG4P49917 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIG4P49917 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIG4P49917 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIG4P49917 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIG4P49917 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIG4P49917 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIG4P49917 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIG4P49917 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIG4P49917 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIG4P49917 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIG4P49917 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIG4P49917 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIG4P49917 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIG4P49917 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIG4P49917 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms