Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP153P49790 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP153P49790 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP153P49790 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP153P49790 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP153P49790 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP153P49790 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP153P49790 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP153P49790 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP153P49790 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP153P49790 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP153P49790 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP153P49790 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NUP153P49790 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NUP153P49790 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NUP153P49790 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NUP153P49790 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NUP153P49790 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NUP153P49790 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NUP153P49790 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
NUP153P49790 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NUP153P49790 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NUP153P49790 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP153P49790 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP153P49790 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP153P49790 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUP153P49790 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUP153P49790 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUP153P49790 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUP153P49790 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUP153P49790 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUP153P49790 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUP153P49790 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NUP153P49790 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NUP153P49790 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NUP153P49790 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NUP153P49790 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP153P49790 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP153P49790 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP153P49790 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP153P49790 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP153P49790 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP153P49790 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP153P49790 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP153P49790 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP153P49790 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP153P49790 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP153P49790 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP153P49790 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP153P49790 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP153P49790 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP153P49790 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP153P49790 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP153P49790 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP153P49790 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP153P49790 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP153P49790 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP153P49790 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP153P49790 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP153P49790 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP153P49790 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP153P49790 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP153P49790 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
NUP153P49790 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.1
NUP153P49790 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
NUP153P49790 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP153P49790 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP153P49790 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP153P49790 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP153P49790 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP153P49790 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP153P49790 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP153P49790 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP153P49790 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP153P49790 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP153P49790 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP153P49790 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP153P49790 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP153P49790 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP153P49790 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP153P49790 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP153P49790 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP153P49790 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP153P49790 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP153P49790 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP153P49790 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP153P49790 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP153P49790 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP153P49790 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUP153P49790 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUP153P49790 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUP153P49790 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUP153P49790 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUP153P49790 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
NUP153P49790 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
NUP153P49790 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUP153P49790 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUP153P49790 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUP153P49790 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUP153P49790 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms