Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASP4P49662 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASP4P49662 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASP4P49662 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP4P49662 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP4P49662 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP4P49662 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP4P49662 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP4P49662 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP4P49662 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP4P49662 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP4P49662 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP4P49662 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP4P49662 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP4P49662 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP4P49662 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP4P49662 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP4P49662 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP4P49662 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP4P49662 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP4P49662 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP4P49662 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP4P49662 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP4P49662 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP4P49662 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP4P49662 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP4P49662 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP4P49662 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP4P49662 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP4P49662 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP4P49662 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP4P49662 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP4P49662 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP4P49662 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP4P49662 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP4P49662 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP4P49662 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP4P49662 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP4P49662 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP4P49662 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP4P49662 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP4P49662 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP4P49662 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP4P49662 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP4P49662 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP4P49662 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP4P49662 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP4P49662 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP4P49662 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP4P49662 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP4P49662 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP4P49662 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP4P49662 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP4P49662 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP4P49662 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP4P49662 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP4P49662 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP4P49662 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP4P49662 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP4P49662 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP4P49662 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP4P49662 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP4P49662 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP4P49662 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP4P49662 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP4P49662 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP4P49662 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP4P49662 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP4P49662 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP4P49662 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms