Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT3P49368 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT3P49368 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT3P49368 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT3P49368 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT3P49368 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT3P49368 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT3P49368 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT3P49368 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT3P49368 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT3P49368 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT3P49368 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT3P49368 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT3P49368 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT3P49368 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT3P49368 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT3P49368 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT3P49368 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT3P49368 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT3P49368 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT3P49368 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT3P49368 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT3P49368 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT3P49368 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT3P49368 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT3P49368 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT3P49368 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT3P49368 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT3P49368 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT3P49368 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT3P49368 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT3P49368 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT3P49368 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT3P49368 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT3P49368 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT3P49368 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT3P49368 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT3P49368 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT3P49368 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT3P49368 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT3P49368 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT3P49368 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT3P49368 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT3P49368 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT3P49368 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT3P49368 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT3P49368 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT3P49368 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT3P49368 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT3P49368 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT3P49368 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT3P49368 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCT3P49368 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCT3P49368 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCT3P49368 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCT3P49368 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCT3P49368 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCT3P49368 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCT3P49368 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCT3P49368 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCT3P49368 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCT3P49368 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCT3P49368 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCT3P49368 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCT3P49368 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCT3P49368 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCT3P49368 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCT3P49368 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCT3P49368 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCT3P49368 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCT3P49368 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCT3P49368 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCT3P49368 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCT3P49368 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCT3P49368 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCT3P49368 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCT3P49368 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCT3P49368 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCT3P49368 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms