Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTAP49354 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTAP49354 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTAP49354 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTAP49354 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTAP49354 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTAP49354 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTAP49354 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTAP49354 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTAP49354 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTAP49354 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTAP49354 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTAP49354 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTAP49354 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTAP49354 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTAP49354 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTAP49354 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTAP49354 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTAP49354 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTAP49354 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTAP49354 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTAP49354 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTAP49354 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTAP49354 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTAP49354 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTAP49354 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTAP49354 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTAP49354 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTAP49354 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTAP49354 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTAP49354 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTAP49354 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTAP49354 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTAP49354 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTAP49354 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTAP49354 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTAP49354 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTAP49354 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTAP49354 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTAP49354 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTAP49354 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTAP49354 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTAP49354 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTAP49354 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTAP49354 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTAP49354 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FNTAP49354 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
FNTAP49354 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FNTAP49354 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FNTAP49354 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTAP49354 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTAP49354 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTAP49354 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTAP49354 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTAP49354 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTAP49354 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTAP49354 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTAP49354 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTAP49354 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTAP49354 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTAP49354 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTAP49354 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTAP49354 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTAP49354 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTAP49354 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTAP49354 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTAP49354 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTAP49354 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTAP49354 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTAP49354 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTAP49354 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTAP49354 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTAP49354 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTAP49354 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTAP49354 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTAP49354 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTAP49354 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTAP49354 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTAP49354 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTAP49354 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTAP49354 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTAP49354 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTAP49354 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms