Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms