Protein–RNA interactions for Protein: P48736

PIK3CG, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CGP48736 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CGP48736 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CGP48736 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CGP48736 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CGP48736 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CGP48736 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CGP48736 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CGP48736 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CGP48736 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CGP48736 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CGP48736 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CGP48736 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CGP48736 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CGP48736 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CGP48736 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CGP48736 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CGP48736 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CGP48736 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CGP48736 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CGP48736 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CGP48736 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CGP48736 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CGP48736 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CGP48736 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CGP48736 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CGP48736 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CGP48736 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CGP48736 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CGP48736 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CGP48736 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CGP48736 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CGP48736 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CGP48736 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CGP48736 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CGP48736 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CGP48736 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CGP48736 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CGP48736 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CGP48736 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CGP48736 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CGP48736 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CGP48736 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CGP48736 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CGP48736 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CGP48736 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CGP48736 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CGP48736 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CGP48736 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CGP48736 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CGP48736 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CGP48736 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CGP48736 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CGP48736 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CGP48736 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CGP48736 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms