Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSFP46459 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSFP46459 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSFP46459 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSFP46459 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSFP46459 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NSFP46459 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSFP46459 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSFP46459 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSFP46459 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSFP46459 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSFP46459 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSFP46459 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSFP46459 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSFP46459 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSFP46459 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSFP46459 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSFP46459 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NSFP46459 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSFP46459 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NSFP46459 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSFP46459 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSFP46459 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSFP46459 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSFP46459 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSFP46459 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSFP46459 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSFP46459 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSFP46459 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSFP46459 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NSFP46459 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSFP46459 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSFP46459 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSFP46459 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSFP46459 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSFP46459 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSFP46459 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSFP46459 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSFP46459 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSFP46459 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSFP46459 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSFP46459 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NSFP46459 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSFP46459 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSFP46459 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSFP46459 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSFP46459 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSFP46459 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSFP46459 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSFP46459 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NSFP46459 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSFP46459 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSFP46459 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSFP46459 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSFP46459 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSFP46459 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSFP46459 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSFP46459 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSFP46459 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSFP46459 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSFP46459 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSFP46459 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSFP46459 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSFP46459 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSFP46459 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSFP46459 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSFP46459 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSFP46459 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSFP46459 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSFP46459 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NSFP46459 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSFP46459 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSFP46459 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSFP46459 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSFP46459 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSFP46459 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSFP46459 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSFP46459 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSFP46459 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms