Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MTHFRP42898 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms